Зал 1 «Родина Ломоносова»
Зал 2 «Родина Ломоносова»
Зал 3 «Путь в науку»
Зал 4 «Ломоносов- учёный»
Зал 5 Ломоносов- поэт и просветитель»
Зал 6 «Памяти Ломоносова»
Зал 7 «Памяти Ф.И. Шубина»
Зал 7 Холмогорская резная кость
Зал 7 Сельская картинная галерея
Зал 8 Зал временных выставок (конференц-зал)
Фотографии музея Ломоносова
Выставочный зал (архив)